Установено е, че основният компонент па прополиса са флавоноидите, но освен тях съдържа и редица органични киселини, терпени, алдехиди, естери, алкохоли, етери, минерални вещества, аминокиселини и др.
Флавоноидите съставляват над 25% от всички компоненти. Основното ядро на флавоноидите в прополиса е флавоновото (а). С цифри са означени въглеродните атоми — 1 е кислородният атом. Флавоноидите на прополиса са производни на флавона (а) н флавонона (б), в чиито ядра някои водородни атоми са заместени с хидроксилни (ОН) или метокси (ОСН3)
Следователно флавоноидите в клея може да се разглеждат като полифеноли и техни метилови етери. Особено голям е приносът на Попровко (1969, 1975) при идентифицирането ма много от тях чрез използуване на хроматографскн методи, ултравиолетова и инфрачервена спектрофотометрия, ядреномагяитен резонанс и масспектрометрия.
Прополисът съдържа следните флавоноидп в количество от 1 до 4%: хризин, тектохризин, акацетин, кверцетин, кемпферид, пиностробин, пнноцембрин, рамоцитрин, галанин, изалпинин, пектолинаригенин, сакуранетин, изосакуранетин, пинобанксин, апигенин, кемпферол, рамназин, изорамнетин, бетулетол, диметилов етер иа пинобанксина, ацетнлпинобанксин, 5-хидрокси-4,7-димероксифлавон, 3,5-дихидрокси — 4,7-диметоксифлавон, 5,7-дихндрокси-З, 4-диме- токсифлавон и 5-хидрокси-4,7-диметоксифлавон.
Поправко е установил, че много от компонентите на прополиса се съдържат н в смолистото вещество по пъпките на брезата и на тополата. Тъй като насекомите нямат биосинтетичен апарат, способен да синтезира флавоноиди, ясно е, че основните части на прополиса имат растителен произход. Докато в растенията флавоноидите са обикновено под форма на глнкозиди, в пчелния клей са в свободно състояние. Вероятно първичният растителен материал попада под действието на ензимите на пчелите, т. е. отцепват се захарните остатъци и се освобождават флавоноидите в свободно състояние.
Флавоноидният състав на прополиса показва известни различия в зависимост от растителните видове, от които е събран. Прополисът съдържа и представители на други групи органични съединения. Освен посочените съединения прополисът съдържа етери , терпени , птеростилбен, фенолни триглицериди, нафталин и др. Количеството на отделните вещества варира в широки граници, а някои от тях се съдържат само в определени, видове пчелен клей.
Прополисът съдържа значително количество минерални вещества. Чанишев и Кудашев (1976) чрез спектрален анализ са установили присъствие на манган, цинк, барий, титан, мед, калай, никел, кобалт, ванадий, хром, олово (от 0 до 11 060 pg/100g), а Карданов и сътр. (1980) освен посочените елементи — калций, фосфор, калий, сяра, натрий, хлор, желязо, магнезий, молибден, алуминий, силиций, живак, селен, цирконий, флуор и антимон. Много голямо в сравнение с другите елементи е количеството на цинка и мангана.
Съветски, румънски и италиански изследователи са установили, че пчелният клей съдържа от 8 до 17 аминокиселини — сернн, гликокол, аспарагинова и глутаминова киселина, аланин, триптофан, фенилаланин, левцин, цистин, лизин, хистидин, ар- гиннн, пролин, треонин, тирозин, метионин и валин. Общото колчество азот достига 0,64%.
Някои автори отбелязват, че в пчелния клей попадат и вещества, които се отделят от слюнчените жлези на пчелите при събирането му от растенията. Такива вещества са някои ненаситени мастни киселини и преди всичко 10- хидрокси-2-деценовата, която се отделя от мандибуларните жлези и е основна съставка на млечицето. Количеството й в прополиса според Вахонина е 7,2%.
Посочените дотук съставки са изолирани след отстраняване на механичните примеси и на восъка. Поради това че в клея винаги се съдържа известно количество восък, всички компоненти на восъка влизат в състава и на прополиса. Известно е, че пчелният восък се състои от около 70% естери на висшите мастни киселини и на висшите мастни алкохоли, 10—15% въглеводороди, свободни мастни киселини, алкохоли и т. н.
Повечето компоненти на прополиса нмат растителен произход. Това се отнася за флавоноидите, органичните киселини, терпеннте, алкохолите и естерите, горяма част от които се съдържат в соковете на пъпките на растенията. Тези съединения играят определена физиологична роля при растенията. Известно е, че повечето флавоноиди и органични киселини, съдържащи се в смолата от пъпките, от една страна, потискат растежа на растенията, а, от друга, имат силно изразена антимикробна активност.
По време на покоя на пъпките те пречат на развитието им и същевременно служат за защита от фитопатогенните микроорганизми. През този период количеството на задържащите растежа компоненти е голямо. През пролетта и лятото (по време на развитието) тези компоненти намаляват или изчезват (не са вече необходими) и остават съставките, които играят защитна роля. Следователно пъпките са под сложен биохимичен контрол. В съответствие с това схващане Поправко е установил, че има два вида прополис. Първият вид по състав прилича на отделяното лепкаво вещество от пъпките в покой, а другият — на секретите на развиващите се пъпки.
Въпреки че досега са изолирани много съединения от прополиса, голяма част от компонентите му остават неизвестни. Изолирани са и са проучени повечето вещества, които се намират във водните извлеци и в извлеците на органичните разтворители. Част от прополиса обаче не се разтваря във вода или в органични разтворители. Вероятно тя се състои от природни полимерни продукти, проучването на които изисква продължителна изследователска работа.
В сравнение с другите пчелни продукти прополисът си остава все още най-слабо проученият. Вариращият му състав, зависещ от растителните видове, от които е събран, усложнява изясняването на вида и количеството на компонентите и охарактеризирането на свойствата му.